ก่อสร้างขึ้นในปี พ.ศ. 2532 เพื่อสนับสนุนให้มีการเร่งรัดสร้างสรรค์งานวิจัยด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี ให้กับหน่วยงานหลักของประเทศในการรับรองการพัฒนาเศรษฐกิจประเทศ โดยกรมธนารักษ์ได้อนุญาตให้ กระทรวงวิทยาศาสตร์เทคโนโลยีและสิ่งแวดล้อม ใช้ที่ราชพัสดุแปลงที่ 567 และ 568 บริเวณตำบลคลองห้า อำเภอคลองหลวง จังหวัดปทุมธานี เพื่อจัดตั้งเป็นศูนย์รวมกิจกรรมทางวิทยาศาสตร์ มีเนื้อที่รวมทั้งหมด 574 ไร่ 1 งาน 70 ตารางวา คลิปแนะนำเทคโนธานี 30 ปี มุ่งสู่นวัตกรรม https://youtu.be/RRFo2BXNiv4
พื้นที่ภายในเทคโนธานี แบ่งออกเป็น 5 โซน 7 หน่วยงาน
Zone 1 วิทยาศาสตร์
Zone 2 เทคโนโลยี
Zone 3 นวัตกรรม
Zone 4 สิ่งแวดล้อม
Zone 5 พลังงาน